由於悟空吸取日月精華，加上天資聰敏，很快便成為法力高強的仙猴。另一方面，李靖夫人殷氏懷孕三年多，終誕下哪吒。哪吒天生聰敏，兼賦異稟。但父子關係持續惡劣。
為到東海求兵器，悟空更大鬧龍宮，終取得穩住東海的法寶定海神針作為武器 - 金剛捧，卻引起了地震、海嘯。東海龍王三子敖丙，奉父親之命幫助收浪時巧遇哪吒，哪吒不明就裏，以為是牠興風作浪，於是抽了敖丙的筋作懲罰。東海龍王大怒上天庭向王皇大帝告狀。李靖驚聞哪吒所為，決定殺哪吒謝罪。殷夫人情急下自殺以死代罪。哪吒因深恨父親迫死母親，削骨肉還父。最後其魂魄被太乙真人所救，從此跟隨太乙學法修道。
悟空得到金剛棒後，舉行“揚棍立威大會”遇上魔界第一美人白骨精。這時，天庭眾神發現悟空本領高強，故以懷柔政策封為悟空為弼馬溫。
悟空在天庭遇上天宮花園的萬花之首 – 紫蘭仙子，原來紫蘭仙子便是一億年前落在花果山殞石上滋生的紫蘭花。在天庭期間，悟空更結識了哪吒，二人不打不相識，更後更成為好友。某日，悟空發現及不滿自己身份低微，再次大鬧天宮及蟠桃大會，種下被貶的原因。最後如來出手，將悟空永遠壓在五指山下。哪吒欲救悟空不果，反被李靖困入玲瓏塔。紫蘭亦為悟空求情，反被罰面壁思過五百年。
四百八十多年後，金山寺唐三藏年值十八歲；唐三藏有靈異能力，並且有過目不忘本領，通曉梵文，是語言文字專家。
此時，太陽黑子劇爆，天宮大變，如來及觀音推算到太陽黑子會在十多年後再發生大爆炸，如來唯有借助唐太宗之力找到三藏，同時亦知悉悟空為經文中所提的一石。在如來和觀音的引導下，悟空戴上金箍，踏上護送三藏到西天取經的旅程。
在旅程初期，唐僧更收了白龍馬、沙僧及豬八戒為徒，一起上路。由於悟空生性傲慢衝動，與仁慈的唐僧經常因觀點而發生衝突。
在上路的途中，唐三藏不滿悟空殺生而責罵悟空，悟空一怒之下離開了眾人。當悟空回到花果山。可是當唐三藏等人遇上另一妖怪蛇魔時，悟空仍忍不住救師父之心，趕去迎救。因此事件，師徒關係得以加深。
白骨精吃下會迷倒天下眾生的情花，最後為天魔所利用。而紫蘭亦從天牢裡放出，逃出天庭往尋悟空。
眾人到達火焰山，遇上紅孩兒、六耳彌猴、牛魔王及火翼道人等合謀襲擊，最後悟空等人亦能將之擊敗。而李靖父子此時卻受白骨精所迷惑，大打出手，哪吒後來更被天魔迷惑，憤怒入魔。
火焰山一役後，八戒被鬼上身，更召喚群鬼夾擊眾人，此時唐僧遇上一可憐女鬼素素，應她的請求，到鬼域驅走黑風老妖，為她找出屍首。眾人終於來到黑風山，黑風老妖擺下陰風大陣，哪吒亦為陣中支柱！黑風老妖使出呼魂大法，悟空等身陷險境。眾師兄弟無法破鬼陣之際，唐僧割脈放血，漫天血雨，大小惡鬼蜂擁前來吸血，全部皆得到聖血超渡，苦戰下敗黑風老妖。此時悟空變得重情重義，功力大進。經黑風山一役，悟空師徒間亦變得團結起來。
穿過黑風山，進入西域。發現鄉民都出奇地誠心，可是這些被供奉的全屬天庭墜落的神仙法寶。
天魔派出之寵物法寶亦開始作惡，八戒先遇上九龍女婿的情人 – 大話王蜘蛛精，對之一見傾心。蜘蛛精只一心借八戒親近唐僧，慾食唐僧肉。此時，妖物原形畢露，組成百獸大陣，悟空奮力迎擊，以鼎湖上法寶----禹鼎敗百獸大陣。
擊潰百獸大陣後，眾人繼續上路，不一日竟然就來到假西天，眾人滿心歡喜，以後任務完成，安然渡過天劫，可是修為高深的唐僧卻發現這只一個幻象。幻象眾人的醒覺而消失，但時間竟已消磨，天劫已迫在眉睫。禍不單行，此時，另一佛門聖物----七寶天羅傘殺到。悟空無法獨力對抗七寶羅傘，唯唐僧最是澄明，以其最心無雜念之心，舉手之間，便把此佛門聖物收服。
蜘蛛精吃唐僧肉不果，欲吃八戒，八戒雖能逃脫，卻為情所傷。此時豬八戒竟然誤飲西梁女國的子母泉泉水，竟出奇地懷有身孕，幸而八戒最後都能成功將胎兒打掉，向西梁女兒國進發。進入西梁女兒國，三藏等人發現國內的人民全是女人。原來，由於在數百年前一個皇帝厲行滅佛政策，一個僧人含冤而死前落下毒咒，只可生育女兒。唐僧、沙僧八戒及悟空誤打誤撞，找出素素，同時發現素素為三顆殞石之一，但她的殞石在墜落凡間之時沾染了紅麈，令她一時能與殞石完全結合。
此時，天魔的力量逐漸增大。血魔在唐僧上路途中出現截擊，悟空等人苦戰受傷，一向怕事的素素挺身而出，亦陷苦戰。幸得七寶羅傘出現，淨化聖光將血魔溶化，素素亦在佛光之下得到淨化，與石殼完全結合。
眾人終於到達西天大雷音寺，得到大成金經回中土，從此，唐太宗下旨將大成經典傳揚開去。
就在此時，太陽黑子影響力漸增，宇宙風暴轉強。天魔的力量進一步逐漸強大。天魔在封印黑洞內蠢蠢欲動，群仙力量進一步衰退，天劫來臨。悟空師徒立即前去阻止天魔破洞而出。在天魔之妖力號召，哪吒前去黑洞。此時，已覺悟反省的李靖天王，為了挽救解求世界的浩劫，決定犧牲自己，勸服身為三顆封印天魔的殞石的哪吒改邪歸正，幫助救世。哪吒敵不過骨肉之情，終於能擺脫心魔，合力挑戰天魔。
三石匯合，終於可以打開大乘金經的內在秘密，此時，全國國民頌讀經文，以集體念力，與天魔鬥至勢均力敵。天魔暗算悟空，紫蘭為悟空擋招，白骨精亦悔過覺悟，甘願為悟空犧牲性命。悟空悲極頓悟忘情，到達超凡入聖的境界，發揮最強功力。三人一起用念力將天魔推入黑洞，並成功封印。諸天神佛亦克服了天劫，重新得到力量。